Nature Biotechnology | 病毒分类工具的代际飞跃：vConTACT3如何超越前代，重塑宏基因组分析标准？

在这个星球上，没有任何生命形式在数量和多样性上能与病毒相提并论。据估算，地球上大约存在1031 个病毒 颗粒。这是一个什么概念？如果把它们排列起来，长度甚至超过了银河系的直径。然而，面对如此庞大的数 字，人类目前所掌握的知识却显得微不足道。 即使是在基因组测序技术突飞猛进的今天，像 IMG/VR (Integrated Microbial Genome/Virus Resource) 这样最庞大 的病毒基因组数据库，也仅仅收录了约 1530万 个病毒基因组片段。这与真实世界相比，连九牛一毛都算不 上。更令人焦虑的是，即便是这"九牛一毛"中，能够被国际病毒分类委员会 (ICTV) 正式分类和命名的，还不 到 0.01%。 这是一个巨大的不对称：我们的测序能力在指数级增长，每一滴海水、每一克土壤都在告诉我们要发现成千上 万的新病毒，但我们的分类体系却像是一台老旧的打字机，试图跟上超级计算机的输出速度。传统的分类方法 依赖于专家的手工 (Manual Curation)，这种方式虽然严谨，但在宏基因组学 (Metagenomics) 的海量数据面前显 得捉襟见肘。 12月19日，《Nature Biotechnol ...