本报北京电（张子震、刘胜德）第15届北京大学消化肿瘤论坛暨中国胃肠肿瘤临床研究协作组 （CGOG）年会日前在北京举行。本次会议以"创新、精准、聚力"为主题，立足消化系统肿瘤的精准诊 疗与转化研究，聚焦最新研究进展和方向，积极推进创新诊疗模式和新药研发。 会上，国家蛋白质科学中心理事长贺福初院士介绍了人体蛋白质组导航计划（π-HuB计划），旨在通过 蛋白质组的复杂性与动态性，揭示生命系统的结构与功能基础。计划的首要任务是挖掘人体蛋白质中与 生命相关的信息，设定了四大目标：一是绘制人体蛋白质组的层次结构图谱；二是构建蛋白质组状态空 间图谱，追踪蛋白质谱系；三是建立元人体数字模型，进行数字化人体结构表征；四是在蛋白质组状态 空间中进行导航，预测疾病状态、预判疾病风险，并预警亚健康和重大疾病的发生。蛋白质组学驱动的 肿瘤精准医学时代的到来，为消化道肿瘤等疾病的诊断与治疗带来了显著的突破与益处。 针对上消化道肿瘤危害国人健康且治疗手段匮乏，北京大学肿瘤医院沈琳教授提出"B to B"双向转化研 究模式，针对HER2、EGFR和CLDN18.2等靶点探索新的治疗方案。据其介绍，细胞治疗已经在实体瘤 领域大显身手，免疫治疗 ...

撰文丨王聪 编辑丨王多鱼 排版丨水成文 细胞 （Cell） 作为生命的基本单位，是一个极其复杂精妙的实体，其特性和行为对物理和计算模型的极限构成了挑战。每个细胞都是一个动态且具有适应性的系 统，在其中，复杂的活动源自无数的分子间相互作用。为了理解细胞的功能， 科学家们试图构建 虚拟细胞 （ Virtual Cell ） 模型来模拟、预测和引导细胞的行 为。 如今，在 人工智能 和 组学 领域发生的令人振奋的科技革命，使得直接从数据中学习构建细胞模型成为可能。这些科技革命为一个雄心勃勃的 人工智能虚拟细胞 （AIVC） 愿景提供了前所未有的机遇，AIVC 是一种基于大规模神经网络的多尺度、多模态模型，能够表征和模拟分子、细胞和组织在各种状态下的行为。 目前，已有多个研究团队正在竞相开发 人工智能 （AI） 模型，以建模生命的基本单位—— 细胞 ，并预测细胞的行为。 2024 年 12 月 12 日， "陈-扎克伯格倡议" （CZI） 的科学负责人 Stephen Quake 联合 40 多位学者，在 Cell 期刊发表了题为： How to build the virtual cell with artific ...

鹭羽 发自 凹非寺 量子位 | 公众号 QbitAI 谷歌DeepMind Alpha家族又双叒登上Nature报道，这次瞄准的是DNA变异。 现在只需1秒，就能精确定位基因组序列变异。 据Nature最新报道， 谷歌DeepMind团队 目前推出了突破性生物模型 AlphaGenome 。 它能够从长达 1兆碱基 的DNA序列中，同时预测数千种功能基因组特征，并以单碱基分辨率评估变异效应。 在基因表达、剪接、染色质可及性等多种任务上性能 全面超越现有模型 ，为解析基因组调控代码提供了强大工具。 作者将其描述为整个生物领域的里程碑： 我们第一次拥有了一个单一的模型，它统一了整个基因组任务范围内的远程上下文、基本精度和最先进的性能。 在未来，AlphaGenome也会更好地帮助我们理解疾病，癌症这本"天书"也许终于得以破解。 该工具将提供一块关键的拼图，使我们能够建立更好的联系来了解癌症等疾病。 首个统一基因组任务的单一模型 模型通过 预训练 和 蒸馏 两阶段进行训练： 最终实现在 NVIDIA H100 GPU 上，学生模型的推理时间能达到 一秒 以内，具有极高的效率。 性能全面超越现有技术 为了评估Alph ...

Core Viewpoint - The research conducted by BGI and Southern University of Science and Technology has created a groundbreaking 3D single-cell spatiotemporal multi-omics atlas of Drosophila development, providing unprecedented insights into the molecular mechanisms of cell-type differentiation and developmental biology [2][4][25]. Group 1: Research Methodology - The research team utilized BGI's proprietary spatiotemporal omics technology, Stereo-seq, along with single-cell sequencing techniques (scRNA-seq and scATAC-seq) to sample key stages of Drosophila development, generating over 3.8 million spatially resolved single-cell transcriptomes [3][7]. - The Spateo algorithm was employed to reconstruct high-precision 3D models, allowing for detailed analysis of tissue morphology and gene expression dynamics [7]. Group 2: Key Findings - The study systematically analyzed the spatiotemporal dynamics of cell-type differentiation in Drosophila, revealing critical regulatory networks that govern developmental processes [4][9]. - A "differentiation trajectory map" was constructed, elucidating the molecular mechanisms behind cell fate determination, with transcription factors acting as key regulators [9][22]. - The research identified previously uncharacterized transcription factors that play significant roles in the nervous, digestive, and endocrine systems, expanding the understanding of developmental regulation [9][22]. Group 3: Developmental Patterns - The 3D multi-omics atlas revealed the spatial patterns of tissue differentiation, with distinct developmental modes observed in the fat body and fore/hind gut [11][13]. - The fat body exhibited a dispersed differentiation pattern, while the fore/hind gut showed a centralized characteristic, providing new evidence for understanding embryonic gut formation [13]. Group 4: Central Nervous System Development - The study highlighted key nodes in the morphological remodeling of the central nervous system, identifying new regulatory factors associated with neural progenitor cell migration [14][22]. - The dynamic changes in midgut cell types and their spatial organization were tracked, revealing that midgut stem cells had already "prepared" for future differentiation during the larval stage [18][19]. Group 5: Implications for Human Health - Drosophila serves as a crucial model organism in various biological fields, sharing approximately 70% of disease-related genes with humans, thus providing valuable insights into human developmental diseases [9][25]. - The findings regarding the regulation of copper cells in the midgut may offer new mechanisms for understanding organ development in humans [22].

总体而言，该研究系统性地剖析了运动重塑人体生理、延缓衰老的关键分子枢纽，开拓了科学抗衰的新路径，为推进健康老龄化研究提供了重要的科学依 据。 （总台央视记者 帅俊全 褚尔嘉） △口服甜菜碱有效降低老年小鼠肝脏脂肪化，对照组（左）；干预组（右） 记者从中国科学院动物研究所获悉，该所刘光慧研究员、曲静研究员联合国家生物信息中心张维绮研究员、中国科学院动物研究所宋默识研究员及首都医科 大学宣武医院王思研究员团队，历时六年，首次系统解析了人体对急性单次运动与长期规律运动的分子-细胞动态响应谱，揭示肾脏是运动效应的关键应答 器官——其内源代谢物甜菜碱作为衰老延缓的核心分子信使，通过靶向抑制天然免疫枢纽激酶TBK1，协同阻遏炎症并缓解多器官衰老进程。这一成果北京 时间6月25日在国际学术期刊《细胞》发表。 △运动健康效益及其分子机制 在这项研究中，科研人员首次将运动适应性反应这一复杂的系统生物学问题解构为一个可量化的多组学动态网络。系统解析了单次急性运动与长期规律运动 后的生理适应表现与机制。研究首次解析了急性与长期运动的分子分界：急性运动激发"生存应激型"代谢风暴与氧化损伤，而长期运动则驱动健康导向的代 谢-免疫稳态重 ...

Core Insights - Illumina announced the acquisition of SomaLogic for $350 million in cash, aimed at enhancing its position in the growing proteomics market and accelerating its multi-omics strategy for 2024 [1][3] - The acquisition is based on a prior collaboration established in December 2021, focusing on integrating SomaLogic's protein detection technology into Illumina's NGS platform [3][4] - The global proteomics market is projected to grow from $33.6 billion in 2024 to $60.5 billion by 2029, with a compound annual growth rate (CAGR) of 12.4% [9] Company Strategy - Illumina's CEO stated that the acquisition will enhance the value of the NovaSeq X product and unlock greater potential for future advancements [3] - The integration of SomaLogic's technology with Illumina's scalable NGS platform and analysis software is expected to accelerate technological development in proteomics and reduce research time and costs [3] - The company aims to complete the acquisition by mid-2026, pending regulatory approvals, while both companies will continue to operate independently until then [4] Market Context - Illumina holds over 80% of the global gene sequencing market but has faced revenue declines and significant losses, particularly a projected loss of $1.223 billion in 2024 [6] - The company has been impacted by being placed on the "unreliable entity list" in China, affecting its business in the Greater China region [6] - The competitive landscape is intensifying, with rivals like Roche Diagnostics and BGI encroaching on Illumina's market share [6] Industry Trends - The proteomics field is seen as a critical area for future diagnostics and drug development, with the potential to discover new biomarkers and therapeutic targets [7] - Recent acquisitions in the proteomics space, such as Thermo Fisher's $3.1 billion purchase of Olink Holding AB, indicate a growing interest and investment in this sector [10] - Illumina's acquisition of SomaLogic is expected to strengthen its capabilities in the high-growth proteomics market, with profitability anticipated by 2027 [10]

特别提示 微信机制调整，点击顶部"仪器信息网" → 右上方"…" → 设为 ★ 星标，否则很可能无法看到我们的推送。 圣 地 亚 哥 2025 年 6 月 23 日 ， I l lumina 宣 布 已 与 Standard BioTool s ( 纳 斯 达 克 股 票 代 码 ： LAB) 签 署 了 一 项 最 终 协 议 ， 根 据 该 协 议 ， I l lumina将收购数据驱动蛋白质组学技术领导者SomaLogic和其他指定资产，收盘时需支付 3.5亿美元的现金 ，但需进行相关调整，加上 高达 7500万美元的短期基于绩效的里程碑和基于绩效的特许权使用费 。 I l lumina 首席执行官Jacob Thay sen表示， "收购SomaLogic将加强I l lumina在不断扩大的蛋白质组学市场的存在，并推动我们在2024 年宣布的多组学战略。 这将增强NovaSeq X产品今天的价值,并在未来解锁更大的功能。I l lumina和SomaLogic已经密切合作了三年多，这 种组合提高了我们为客户服务的能力，并加快了我们实现先进生物标志物检测和疾病分析的技术路线图。 " "我们正在将NGS ...

撰文丨王聪 编辑丨王多鱼 排版丨水成文 胚胎发育 包含一系列错综复杂且分层次的细胞命运转变，包括胚层形成以及随后的器官发生。在哺乳动物胚胎发育过程中，由原肠胚形成而来的三个胚层——外 胚层、中胚层和内胚层相互协作，启动器官原基的形成。早期器官发生阶段尤为关键，它为器官的形成奠定了基础蓝图。这一阶段具有广泛的细胞命运程序化指 定事件，并且对发育干扰的高度敏感性，使其成为研究正常胚胎发育和先天性畸形潜在机制的关键窗口。 2025 年 6 月 18 日 ， 东南大学 林承棋 教授 、 华大生命科学研究院 方晓东 研究员、东南大学/南通 大学 罗卓娟 教授、福建医科大学 曹华 教授 、 香港中文 大学 （深圳） 刘瑾 副教授作为共同通讯作者，在国际顶尖学术期刊 Cell 上发表了题为 ： Digital reconstruction of full embryos during early mouse organogenesis 的研究论文。 该研究在 器官发生早期 （E7.5-E8.0） 以 单细胞分辨率 重建了完整的 3D " 数字胚胎 " ，为早期器官形成提供了重要见解，也为研究 发育和疾病提供了一个独 特的空 ...

此次研究结合了空间转录组学（对DNA活性进行测量与图谱绘制）和基因组数据，成功识别出源自同 一祖先但获得额外突变的不同细胞群落。这些细胞的空间分布图，有助于揭示肿瘤的演化路径。这一系 列新发现为精准医疗研究提供了坚实的数据支撑，推动了创新技术应用，从而实现更优疗效、更低副作 用的治疗目标。 团队通过对少量胶质瘤样本（发生在大脑或脊髓中的肿瘤）进行批量RNA测序、肿瘤/正常DNA测序及 空间转录组学分析，识别出肿瘤微环境中的共性特征与独特模式，构建出了这个可供其他科研团队参考 的整合分析框架。 现阶段研究主要聚焦于几种类型的脑癌，但所展示的空间转录组学方法和基因组测序技术，有朝一日将 广泛应用于各类癌症的个体化治疗中。 团队表示，癌症及其治疗从来不是"一刀切"的问题。理解ecDNA在可遗传与非遗传细胞附近的分子行 为，有助于揭示潜在的治疗靶点，并可评估癌症复发的风险。 来源：科技日报 科技日报讯 （记者张梦然）美国希望之城国家医疗中心在最新一期《自然·通讯》上发表文章称，他 们"绘制"了一种创新细胞图谱，首次揭示了癌症进化中一个极其关键角色——"染色体外 DNA"（ecDNA），其可预测突变的致癌基因如何重塑D ...

Core Insights - Congenital heart disease is the most common type of birth defect in newborns, and recent research by Chinese scientists has identified an organ primordium determination zone that provides a crucial theoretical basis for the prevention and treatment of congenital heart disease and other birth defects [1][3] - The study, published in the international academic journal "Cell," utilized single-cell spatial omics analysis to capture the dynamic process of organ formation in mouse embryos, focusing on the early stages of development [1][3] Research Findings - The research team discovered a unique signaling "depression" known as the organ primordium determination zone (PDZ) at 7.75 days of mouse embryonic development, characterized by low signal activity and the expression of various receptor signaling genes [3] - The PDZ area is surrounded by high concentrations of inhibitory and activating signaling molecules, creating a microenvironment conducive to the coordinated development of the heart and foregut [3] - This study provides a new methodology for understanding organ regeneration and tumorigenesis, offering precise scientific evidence for the prevention and treatment of congenital heart disease and related conditions [3]