【总编辑圈点】 DiffInvex通过分析重要编码基因区域与非编码区域的突变情况，确定了"中性"突变率的基线。这种 方法消除了评估中的不确定性。通过对来自约30种组织类型的11000多个人类基因组的数据进行分析， DiffInvex鉴定出了11个在特定类型化疗后突变频率显著增加的基因，其中包括IK3CA、SMAD4和 STK11等已知的关键驱动基因。 此外，该研究还对比了1722个来自健康组织和相应肿瘤类型的基因组，进而发现一些所谓的癌症驱 动因子可能是进化的产物，而不是疾病启动的直接原因。 这一研究为合理设计药物组合提供了可能性，例如将标准的化疗与针对PIK3CA或STK11信号通路 的抑制剂结合使用，或会延缓或阻止癌症复发。其同时有助于改进早期检测方法，减少患者的不必要焦 虑。 西班牙巴塞罗那生物医学研究所团队开发出一种名为DiffInvex的创新计算框架，其可追踪健康细胞 转变为肿瘤，以及肿瘤在化疗过程中的基因进化压力。DiffInvex被应用于超过11000个样本，涵盖了大 约30种不同组织类型的人类癌症和健康组织的基因组数据，成功识别出导致肿瘤对治疗"负隅顽抗"的路 径，并指出了哪些基因可能引发耐药 ...