Cell重磅：让人人都能建立虚拟细胞实验室！科学家创建“细胞语法”，用人类语言预测细胞行为

撰文丨王聪 编辑丨王多鱼 排版丨水成文 生成具有时间分辨率的多细胞预测仍然是一个开放性的计算挑战。 生物信息学 技术和 机器学习 可以根据 单细胞分析中的瞬时快照预测单个细胞类型的细胞轨迹和动态表型变化，但它们无法解释整个多细胞生态 系统中更复杂的时序变化。 因此，我们需要更先进的计算工具来填补测量时间点之间的空白，并利用生物学知识和机制从头预测多细 胞系统中未观测到的新兴行为。 该论文提出一个概念框架—— 细胞行为假设语法 （ Cell Behavior Hypothesis Grammar ） ， 该框架利 用自然语言描述细胞规则来构建数学模型，能够系统地整合生物学知识和多组学数据以生成计算机模拟的 虚拟细胞 （ Virtual Cell ） 模型，从而开展虚拟的"思维实验" （ Thought Experiments ） ，以检验并拓 展我们对多细胞系统的理解，并生成新的验证的假设。 该研究进一步展示了该语法在从头构建机制模型以及利用多组学数据构建模型方面的应用，例如预测癌症 转移、破解癌症耐药性，展示了其应用潜力，并通过模拟大脑发育展示了其更广泛的应用性。该方法将生 物学、临床医学和系统生物学研究与大 ...