Spatial Transcriptomics

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Cell:“鱼与熊掌兼得”!王思远团队开发单分子分辨率、覆盖全基因组的空间转录组学新技术
生物世界· 2025-10-03 04:50
撰文丨王聪 编辑丨王多鱼 排版丨水成文 空间转录组学技术 的发明,彻底改变了生物医学研究,使我们能够以空间分辨率对细胞和组织中的基因活 动进行分析。这些工具已在各种组织和情境中得到广泛应用,为细胞身份、相互作用和组织结构提供了前 所未有的见解,揭示了健康和疾病中的关键分子机制。 现有的 空间转录组学技术 大致可分为两类:1)空间捕获/标记技术,利用高通量测序读取空间标记的转录 本;2)基于图像的技术,利用多重荧光原位杂交 (FISH) 或原位测序 (ISS) 直接检测空间转录本。然 而,这两类方法都存在 " 鱼与熊掌不可兼得 "的困境——前者可实现 全基因组转录本覆盖,但 空间分辨率 较低,且不能保留细胞和亚细胞形态;后者可实现 单分子的空间分辨率,并能保持细胞和亚细胞形态,但 转录组覆盖率低 。 这阻碍了在精细空间尺度上进行无偏倚的全局性转录组分析。 2025 年 10 月 1 日, 耶鲁大学 王思远 团队 (博士后 程育宝 、 党盛源 、 张源 作为共同第一作者 ) 在 国际顶尖学术期刊 Cell 上发表了题为: Sequencing-free whole-genome spatial transcrip ...