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蛋白质基础模型
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华山论剑!蛋白质AI模型哪家强?西湖大学/百图生科推出首个全面测试基准
生物世界· 2025-06-24 08:45
编辑丨王多鱼 排版丨水成文 蛋白质是生命活动的执行者,从疾病治疗到新药开发,都离不开对它们的理解。 在 人工智能 (AI) 浪潮中, 蛋白质科学 正迎来一场革命,从 AI 预测蛋 白质结构,到 AI 从头设计蛋白质,再到 ESM-2、ProtT5 这样的蛋白质基础模型 (PFM) 如雨后春笋般涌现。这些蛋白质基础模型通过分析数以百万计 的蛋白质序列来预测结构、功能和突变影响。但这些模型到底谁更强?为什么有些模型在特定任务上表现优异,在其他任务上却一言难尽? 近日, 百图生科首席科学家、西湖大学讲席教授 李子青 等人推出了首个全面的 蛋白质基础模型基准测试工具—— PFMBench 。 该研究以: PFMBench: Protein Foundation Model Benchmark 为题,于近日发表在了 预印本平台 arXiv 上。 该研究提供了一个全面的基准测试,用于评估蛋白质基础模型 (PFM) 在各种任务中的表现,并附带了一套简化评估方案。从 38 项任务和 17 个模型开 始,进一步确定了 12 个核心模型和 11 个代表性任务,以实现高效且有意义的评估。该研究通过大量实验发现,当前的蛋白质基础模型 ...