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染色体外DNA(ecDNA)
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细胞新图谱揭示关键DNA对癌症进化的作用
Huan Qiu Wang Zi Xun· 2025-06-19 02:47
此次研究结合了空间转录组学(对DNA活性进行测量与图谱绘制)和基因组数据,成功识别出源自同 一祖先但获得额外突变的不同细胞群落。这些细胞的空间分布图,有助于揭示肿瘤的演化路径。这一系 列新发现为精准医疗研究提供了坚实的数据支撑,推动了创新技术应用,从而实现更优疗效、更低副作 用的治疗目标。 团队通过对少量胶质瘤样本(发生在大脑或脊髓中的肿瘤)进行批量RNA测序、肿瘤/正常DNA测序及 空间转录组学分析,识别出肿瘤微环境中的共性特征与独特模式,构建出了这个可供其他科研团队参考 的整合分析框架。 现阶段研究主要聚焦于几种类型的脑癌,但所展示的空间转录组学方法和基因组测序技术,有朝一日将 广泛应用于各类癌症的个体化治疗中。 团队表示,癌症及其治疗从来不是"一刀切"的问题。理解ecDNA在可遗传与非遗传细胞附近的分子行 为,有助于揭示潜在的治疗靶点,并可评估癌症复发的风险。 来源:科技日报 科技日报讯 (记者张梦然)美国希望之城国家医疗中心在最新一期《自然·通讯》上发表文章称,他 们"绘制"了一种创新细胞图谱,首次揭示了癌症进化中一个极其关键角色——"染色体外 DNA"(ecDNA),其可预测突变的致癌基因如何重塑D ...
Cell:中科院深圳先进院甘海云团队揭示ecDNA维持的关键机制
生物世界· 2025-04-28 08:44
编辑丨王多鱼 排版丨水成文 染色体外 DNA (extrachromosomal DNA,ecDNA) 是一种独立于染色体存在的环状 DNA 分子,在 30%-50% 的恶性肿瘤患者中被检测到。尽管早在 1965 年研究人员就在神经母细胞瘤中观察到其存在 (当 时称为双微体) ,但受限于技术手段,其存在的生物学意义长期未被阐明。 近年来的研究发现,ecDNA 可携带完整的致癌基因 (例如 MYC、EGFR) 及其增强子序列。当这些基因从 染色体脱落并环化形成 ecDNA 后,原本的表观遗传修饰 (例如 DNA 甲基化和组蛋白修饰) 记忆丢失,导 致癌基因的异常激活。 临床证据表明,携带 ecDNA 的肿瘤患者往往表现出更高的恶性程度、更强的治疗抵抗和更差的临床预后。 因此,靶向 ecDNA 的抗肿瘤策略 (例如干扰其复制与维持、调控表观遗传重塑) 具有重要治疗潜力。然 而,ecDNA 的复制与维持机制、表观遗传重塑及其在肿瘤发生发展中的精确作用,仍是当前研究的核心挑 战。解决这些问题将为开发新型抗癌疗法提供关键突破口。 2025 年 4 月 28 日,中国科学院深圳先进技术研究院定量合成生物学全国重点实验室、 ...