空间转录组学

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东南大学/华大合作发表最新Cell论文:实现器官发生早期完整胚胎的数字重建
生物世界· 2025-06-19 03:07
撰文丨王聪 编辑丨王多鱼 排版丨水成文 胚胎发育 包含一系列错综复杂且分层次的细胞命运转变,包括胚层形成以及随后的器官发生。在哺乳动物胚胎发育过程中,由原肠胚形成而来的三个胚层——外 胚层、中胚层和内胚层相互协作,启动器官原基的形成。早期器官发生阶段尤为关键,它为器官的形成奠定了基础蓝图。这一阶段具有广泛的细胞命运程序化指 定事件,并且对发育干扰的高度敏感性,使其成为研究正常胚胎发育和先天性畸形潜在机制的关键窗口。 2025 年 6 月 18 日 , 东南大学 林承棋 教授 、 华大生命科学研究院 方晓东 研究员、东南大学/南通 大学 罗卓娟 教授、福建医科大学 曹华 教授 、 香港中文 大学 (深圳) 刘瑾 副教授作为共同通讯作者,在国际顶尖学术期刊 Cell 上发表了题为 : Digital reconstruction of full embryos during early mouse organogenesis 的研究论文。 该研究在 器官发生早期 (E7.5-E8.0) 以 单细胞分辨率 重建了完整的 3D " 数字胚胎 " ,为早期器官形成提供了重要见解,也为研究 发育和疾病提供了一个独 特的空 ...
细胞新图谱揭示关键DNA对癌症进化的作用
Huan Qiu Wang Zi Xun· 2025-06-19 02:47
此次研究结合了空间转录组学(对DNA活性进行测量与图谱绘制)和基因组数据,成功识别出源自同 一祖先但获得额外突变的不同细胞群落。这些细胞的空间分布图,有助于揭示肿瘤的演化路径。这一系 列新发现为精准医疗研究提供了坚实的数据支撑,推动了创新技术应用,从而实现更优疗效、更低副作 用的治疗目标。 团队通过对少量胶质瘤样本(发生在大脑或脊髓中的肿瘤)进行批量RNA测序、肿瘤/正常DNA测序及 空间转录组学分析,识别出肿瘤微环境中的共性特征与独特模式,构建出了这个可供其他科研团队参考 的整合分析框架。 现阶段研究主要聚焦于几种类型的脑癌,但所展示的空间转录组学方法和基因组测序技术,有朝一日将 广泛应用于各类癌症的个体化治疗中。 团队表示,癌症及其治疗从来不是"一刀切"的问题。理解ecDNA在可遗传与非遗传细胞附近的分子行 为,有助于揭示潜在的治疗靶点,并可评估癌症复发的风险。 来源:科技日报 科技日报讯 (记者张梦然)美国希望之城国家医疗中心在最新一期《自然·通讯》上发表文章称,他 们"绘制"了一种创新细胞图谱,首次揭示了癌症进化中一个极其关键角色——"染色体外 DNA"(ecDNA),其可预测突变的致癌基因如何重塑D ...