撰文丨王聪 编辑丨王多鱼 排版丨水成文 以 连接组 和 空间转录组 为代表的多组学研究已进入 单细胞分辨率 时代，这需要具备单细胞水平空间定位能力的参考脑图谱。然而，现有的脑图谱都没能做到 单细胞可见的空间定位。 2025 年 7 月 2 日，海南大学/华中科技大学 骆清铭 院士、 龚辉 教授及加州大学洛杉矶分校 董红卫 教授团队 （ 丰钊 为第一作者 ） 合作，在国际顶尖学术期 刊 Nature 上发表了题为： A mouse brain stereotaxic topographic atlas with isotropic 1 μm resolution 的研究论文。 该研究 以 1 微米的各向同性分辨率绘制了小鼠三维脑区和立体定位图谱 ，该图谱可为大型脑图谱项目提供数据分析和可视化支持，有望成为一种多功能脑科学工 具，用于在单细胞水平上研究整个大脑。 在这项最新研究中 ，研究团队 通过连续微光学切片断层成像技术，以各向同性 1 微米的分辨率呈现了一套基于尼氏染色的小鼠全脑细胞结构数据集。 通过整合多模态图像，研究团队构建了小鼠大脑三维参考图谱—— STAM ，提供了 916 个结构的三维形貌，并能够生 ...

撰文丨王聪 编辑丨王多鱼 排版丨水成文 胚胎发育 包含一系列错综复杂且分层次的细胞命运转变，包括胚层形成以及随后的器官发生。在哺乳动物胚胎发育过程中，由原肠胚形成而来的三个胚层——外 胚层、中胚层和内胚层相互协作，启动器官原基的形成。早期器官发生阶段尤为关键，它为器官的形成奠定了基础蓝图。这一阶段具有广泛的细胞命运程序化指 定事件，并且对发育干扰的高度敏感性，使其成为研究正常胚胎发育和先天性畸形潜在机制的关键窗口。 2025 年 6 月 18 日 ， 东南大学 林承棋 教授 、 华大生命科学研究院 方晓东 研究员、东南大学/南通 大学 罗卓娟 教授、福建医科大学 曹华 教授 、 香港中文 大学 （深圳） 刘瑾 副教授作为共同通讯作者，在国际顶尖学术期刊 Cell 上发表了题为 ： Digital reconstruction of full embryos during early mouse organogenesis 的研究论文。 该研究在 器官发生早期 （E7.5-E8.0） 以 单细胞分辨率 重建了完整的 3D " 数字胚胎 " ，为早期器官形成提供了重要见解，也为研究 发育和疾病提供了一个独 特的空 ...

此次研究结合了空间转录组学（对DNA活性进行测量与图谱绘制）和基因组数据，成功识别出源自同 一祖先但获得额外突变的不同细胞群落。这些细胞的空间分布图，有助于揭示肿瘤的演化路径。这一系 列新发现为精准医疗研究提供了坚实的数据支撑，推动了创新技术应用，从而实现更优疗效、更低副作 用的治疗目标。 团队通过对少量胶质瘤样本（发生在大脑或脊髓中的肿瘤）进行批量RNA测序、肿瘤/正常DNA测序及 空间转录组学分析，识别出肿瘤微环境中的共性特征与独特模式，构建出了这个可供其他科研团队参考 的整合分析框架。 现阶段研究主要聚焦于几种类型的脑癌，但所展示的空间转录组学方法和基因组测序技术，有朝一日将 广泛应用于各类癌症的个体化治疗中。 团队表示，癌症及其治疗从来不是"一刀切"的问题。理解ecDNA在可遗传与非遗传细胞附近的分子行 为，有助于揭示潜在的治疗靶点，并可评估癌症复发的风险。 来源：科技日报 科技日报讯 （记者张梦然）美国希望之城国家医疗中心在最新一期《自然·通讯》上发表文章称，他 们"绘制"了一种创新细胞图谱，首次揭示了癌症进化中一个极其关键角色——"染色体外 DNA"（ecDNA），其可预测突变的致癌基因如何重塑D ...

导读： CRISPR-TO技术实现了对内源RNA空间定位的精准调控，为研究RNA功能及相关疾病提供了新工具。 特别提示 微信机制调整，点击顶部"仪器信息网" → 右上方"…" → 设为 ★ 星标，否则很可能无法看到我们的推送。 近 日 ， 美 国 斯 坦 福 大 学 的 亓 磊 实 验 室 在 Nature 杂 志 在 线 发 表 了 题 为 "Programmable control of spatial transcriptome in l i ve cel l s and neurons" 的 研 究 论 文 ， 开 发 了 一 种 新 型 的 可 编 程 方 法 来 调 控 内 源 RNA 的 空 间 定 位 ， 该 方 法 称 为 CRISPR 介 导 的 空 间 转 录 组 调 控 技 术 （CRISPR-mediated transcriptome organi zation, CRISPR-TO）。该项研究为系统性地研究内源RNA定位在多种生物学体系中的功 能提供了全新的工具。 CRISPR-TO利用I I类VI型CRISPR-Cas13系统进行空间转录组的调控。I I类VI型CRISPR-C ...