撰文丨王聪 编辑丨王多鱼 排版丨水成文 本周 （7 月 7 日-7 月 14 日） ，国际顶尖学术期刊 Cell 共上线了 11 篇研究论文，其中 8 篇来自华人学者，这些研究分别在 结构生物学、AI 蛋 白质进化和设计、AI 基因组模型、脑科学、光遗传学 和 合成生物学 领域取得了新突破。 麻疹病毒聚合酶复合物与非核苷抑制剂的结构及抑制机制 2025 年 7 月 7 日，上海科技大学 张贺桥 / Roger Kornberg 团队在 Cell 期刊发表了题为： Structures of the measles virus polymerase complex with non-nucleoside inhibitors and mechanism of inhibition 的研究论文 【1】 。 该研究解析了 麻疹病毒 （MeV） 聚合酶 复合物及其与非核苷抑制剂结合后的结构，并揭示了抑制机制，为抗病毒药物的理性设计奠定了基础。 AI 蛋白质工程计算模拟方法，实现蛋白质高效进化模拟和功能设计 2025 年 7 月 7 日，中国科学院遗传与发育生物学研究所 高彩霞 团队在国际顶尖学术期刊 Cell 期刊 ...

2.【Hugging Face开源小参数模型SmolLM3】北京时间7月9日凌晨，Hugging Face首席执行官克莱门特·德朗 格（Clement Delangue）宣布，Hugging Face发布并开源小参数模型SmolLM3。拥有128k上下文窗口；支持 英语、法语、西班牙语、德语等6种语言；支持深度思考和非思考双推理模式。（财联社） 3.【浙江大学发布高精准基因组设计AI模型】浙江大学郭国骥教授团队开发出一款用于基因组预测设计的深度学 习AI模型"女娲CE"，能够以超过90%的准确率预测基因组调控区域发生突变之后带来的表型变化，并结合疾病 表型设计出相应的治疗位点。相关成果已发表于国际学术期刊《细胞》。 （财联社） 4.【Hugging Face 桌面机器人 Reachy Mini 开订：长相呆萌，支持超 170 万个 AI 模型】据外媒TechCrunch 报道，Hugging Face旗下最新桌面机器人Reachy Mini的订单现已正式开放，开发者现在已可动手组装与测试。 Reachy Mini将推出两个版本。无线版名为Reachy Mini Wireless，内置Raspberry 5 微 ...

撰文丨王聪 编辑丨王多鱼 排版丨水成文 多细胞生物中的不同细胞类型拥有相同的基因组，但由于基因表达的差异调控，它们表现出高度特化的功能特征。调控序列通过以细胞类型特异性的方式招募序 列特异性转录因子 （TF） 来决定基因表达模式。染色质可及性是调控 DNA 的通用标志，可通过 DNA 酶 I 超敏感性测序 （DNase-seq） 和基于转座酶可及染 色质测序（ATAC-seq）进行测量。利用这些检测方法，已经在哺乳动物中开展了多项大规模工作以绘制全基因组范围内的调控序列。然而，对于大多数物种而 言，全面的细胞类型解析调控序列图谱仍不可用。 该研究建立了 超高通量、超灵敏的单核 ATAC 测序技术 （UUATAC-seq） ，可在一天内高效率高质量的完成一个物种的染色质可及性图谱。基于该技术，研究 团队为五大代表性脊椎动物中绘制候选顺式调控元件图谱，开发了多任务深度学习模型—— 女娲CE （ Nvwa cis -regulatory element ） ，并实现了从基因组序 列到单细胞水平调控元件图谱的直接预测。 研究团队发现，脊椎动物调控语法的保守性明显强于核苷酸序列本身，且该语法将脊椎动物调控原件序列在高维 ...

郭国骥团队自主开发了超高通量、超灵敏度的单核染色质可及性测序技术，在这一技术基础上构建了覆 盖小鼠、鸡、守宫、蝾螈和斑马鱼五种代表性脊椎动物的全组织调控元件图谱，形成优质"数据库"，并 开发出多任务深度学习AI模型"女娲CE"，实现从基因组到细胞图谱的直接预测。 "基于大量优质的数据，'女娲CE'模型在多项指标上超越现有的基因组AI模型。"郭国骥介绍，"女娲 CE"能够预测基因组调控元件发生突变之后对各种细胞类型带来的表型变化，经检测准确率超过90%。 江大学郭国骥教授团队开发出一款用于基因组预测设计的深度学习AI模型"女娲CE"，能够以超过90% 的准确率预测基因组调控区域发生突变之后带来的表型变化，并结合疾病表型设计出相应的治疗位点。 8日，相关成果发表于国际学术期刊《细胞》。据介绍，基因组由DNA组成，不仅包含蛋白质的编码序 列，还包含大量不编码蛋白质的调控序列。这两类序列的协同作用，共同决定了生物体的复杂表型特 征。 "基于'女娲CE'预测出的一个镰刀型贫血症治疗性基因位点，我们对该位点进行修改，使得胎儿血红蛋 白表达量得到提升。"郭国骥表示，"女娲CE"系列模型将帮助研究人员更好地理解遗传病发生的复 ...