近日， 上海人工智能实验室青年研究员 谈攀 联 合 上海交通大学自然科学研究院/物理天文学院/张江高研院/药学院 洪亮 教授团队，在 Nature Communications 期刊发表了题为： Harnessing Protein Language Model for Structure-Based Discovery of Highly Efficient and Robust PET Hydrolases 的研究论文。 该研究发布了用于酶挖掘的蛋白质大模型—— VenusMine ，该 模型融合了蛋白质语言大模型与三维结构分析，通过蛋白质序列、结构和功能之间的隐含映射规则，能在海量的蛋白 数据库中高效挖掘同源性低但功能优异的酶分子。 应用该模型，研究团队成功发现了一系列 PET 水解酶，其中来自 Kibdelosporangium banguiense 的 KbPETase 表现出极高的催化效 率和热稳定性，其最适酶活是模板 IsPETase 的 97 倍。 编辑丨王多鱼 排版丨水成文 塑料废弃物，带来了重大环境挑战，尤其是 聚对苯二甲酸乙二醇酯 （PET） ，是当今使用量最大的饮料包装，用于 碳酸饮料 ...

撰文丨王聪 编辑丨王多鱼 排版丨水成文 在活体动物体内精确控制蛋白质激活的通用策略，对于在体内环境中开展蛋白质功能增益 （gain-of-function） 研究至关重要。 2025 年 5 月 27 日，北京大学化学与分子工程学院 、北大 - 清华生命科学联合中心 陈鹏 团队 与 王初 团队合作 ，在国际顶尖学术期刊 Cell 期刊发表了题为： Machine-learning-assisted universal protein activation in living mice 的研究论文。 该研究利用 人工智能 （AI） 辅助，开发 了一种名为 CAGE-Prox vivo 的邻近激活策略，用于在活体动物中按需激活蛋白质以及调控蛋白-蛋白相互作用，为在活 体条件下的时间分辨生物学研究和按需治疗干预提供了一个通用平台。 $${\mathcal{O}}\;\mathbf{C e l P r e s s}$$ 对生物分子进行高选择性和高时间分辨率的功能增益 （gain-of-function ） 研究具有优势且至关重要，有助于剖析各种生物过 程以及揭示疾病病理。人们已开 展了大量的蛋白质工程研究来操控感兴趣 ...