撰文丨王聪 编辑丨王多鱼 排版丨水成文 近日，由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心、华大生命科学研究院、基因组多维解析技术全国重点实验室、华中科技大学苏州 脑空间信息研究院等国内外 30 多家科研机构组成的超 300 人的科研团队， 在国际顶尖学术期刊 Cell （4篇） 及其子刊 Neuron （4 篇） 、 Developmental Cell （2篇） 集中刊发了 10 篇脑图谱研究论文。 该系列研究成果于 7 月 10 日在 Cell Press 官网以专题形式隆重推介，并登上 Cell 期刊封面。同时， Cell 还刊发了一篇由该项目团队 撰写的评述文章，系统总结了系列成果的科学发现与未来方向。 这些研究揭示了小鼠和灵长类动物大脑中多种细胞类型及其连接情况，封面图片展示了一只猕猴凝视着繁星点点的宇宙，其中星座勾勒 出大脑的轮廓。 本文重点介绍其中发表在 Cell 期刊的 4 篇研究论文。 全球首个猕猴屏状核多模态图谱， 揭秘意识产生的关键脑区 论文题目 ： Single-cell spatial transcriptome atlas and whole-brain connectivity o ...

真核生物细胞的功能由特定的基因表达程序驱动，而这些程序又取决于染色质结构。在这项最新研究中， 研究团队报告了世界上最主要的农作物之一—— 水稻的单细胞多组学图谱 。 研究团队通过同时对来自水稻的八个主要器官 （ 根、茎、幼叶、旗叶、茎尖、分蘖芽、幼穗和种子 ） 的 116564 个细胞的染色质可及性和 RNA 表达进行分析，验证鉴定 出 5 4 个细胞类型，确定了细胞类型特 异性的基因调控网络，并描述了新的细胞状态，例如花分生组织中的"过渡状态"， 全面解析了水稻在组织 层面的功能细胞组成。 基于网络分析，该研究揭示了水稻发育过程中细胞类型特异性调控枢纽 RSR1、F3H 和 LTPL120 的功 能，RSR1 ：在根皮层中高度特异表达，其 突变体的根长显著增加、皮层细胞体积扩大，发挥负调控作 用；F3H ：连接碳代谢与氮代谢的枢纽基因，表达于叶肉和根维管， 突变体的根短缩、光合能力下降、总 氮含量降低，其在碳氮协同中作为关键角色；LTPL120 ：根皮层特异表达，其突变体表现出分蘖数增加、 株高变化，是株型优化的潜在基因靶点。 该研究还分析揭示了细胞类型与农艺性状之间的相关性，以及在进化过程中细胞类型功能的 ...

在全球，大概每10个育龄女性中就有1个饱受子宫内膜异位症的折磨——这是一种影响约1.9亿女性的高 发疾病，90%的患者经历着间断性的盆腔疼痛，26%甚至面临不孕的阴影。 然而，当Organon近日宣布其"明星候选药物"OG-6219在二期临床试验中宣告失败时，这个本应充满希 望的领域再次被蒙上阴霾。 OG-6219曾被寄予厚望，被Organon视为"重塑痛经治疗标准"的突破，但它的失败不仅让Organon的女性 健康创新管线陷入危机，更揭示了子宫内膜异位症药物研发的深层困境： 一个影响数亿人的市场，为何新药寥寥无几？痛经药物的春天究竟何时才能到来？ 01 需求巨大，供给稀缺 痛经，尤其严重的痛经，很可能是一种病——子宫内膜异位症。子宫内膜异位症远不止痛经那么简单， 不仅可以侵袭周围组织和其他器官，导致复杂的症状，还容易在治疗后反复发作，直到绝经后才能缓 解，给患者带来无尽的痛苦折磨。 理论上，子宫内膜异位症拥有巨大的治疗需求与商业空间，但现实却是新药稀缺，研发缓慢。 更早前，拜耳也曾布局这一领域，其靶向孕激素/催乳素（ER/PR）药物Visanne于2010年首次在欧洲获 批，用于治疗子宫内膜异位症引发的疼痛 ...

"一年好景君须记，最是橙黄橘绿时"，这是古人描述秋天柑橘丰收的场景。而现在很多人发现，市场上 几乎四季都有鲜食柑橘。从常见的蜜橘、沙糖橘、沃柑，再到受欢迎的脆蜜金橘、爱媛橙等，有的容易 剥皮，有的香味浓郁，不同品种的柑橘简直让人眼花缭乱。柑橘品种还从比拼甜度，转向兼顾风味与营 养。 你知道吗？柑橘越来越好吃，这背后可是科技的"味道"，是柑橘育种技术进步的结果。 《 人民日报 》（ 2025年07月05日 06 版） (责编：胡永秋、杨光宇) 关注公众号：人民网财经 "液相芯片"，可以被理解为一种筛选工具。想象有一盒五颜六色的"魔法珠子"，每种颜色的珠子会被特 定的基因位点吸附。比如有些珠子被"不怕虫"的位点吸附，有些被"甜度更高"的位点吸附。如果将这盒 珠子放入柑橘培育样本的提取液中，它们会根据自身颜色聚集在对应的位点上。最后用一种特殊的灯照 射，珠子会反射出不同颜色、不同强度的光。科研人员根据这些光的颜色组合，就能判断出这个柑橘样 本具有什么特性。 现在有了这块"芯片"，如同给杂交育种装了导航，我们能预测两种亲本杂交后，可能会出现哪些性状， 并能迅速识别出需要的杂交材料。 同时，我们还发展出了基因编辑技术。 ...

撰文丨王聪 编辑丨王多鱼 排版丨水成文 以 连接组 和 空间转录组 为代表的多组学研究已进入 单细胞分辨率 时代，这需要具备单细胞水平空间定位能力的参考脑图谱。然而，现有的脑图谱都没能做到 单细胞可见的空间定位。 2025 年 7 月 2 日，海南大学/华中科技大学 骆清铭 院士、 龚辉 教授及加州大学洛杉矶分校 董红卫 教授团队 （ 丰钊 为第一作者 ） 合作，在国际顶尖学术期 刊 Nature 上发表了题为： A mouse brain stereotaxic topographic atlas with isotropic 1 μm resolution 的研究论文。 该研究 以 1 微米的各向同性分辨率绘制了小鼠三维脑区和立体定位图谱 ，该图谱可为大型脑图谱项目提供数据分析和可视化支持，有望成为一种多功能脑科学工 具，用于在单细胞水平上研究整个大脑。 在这项最新研究中 ，研究团队 通过连续微光学切片断层成像技术，以各向同性 1 微米的分辨率呈现了一套基于尼氏染色的小鼠全脑细胞结构数据集。 通过整合多模态图像，研究团队构建了小鼠大脑三维参考图谱—— STAM ，提供了 916 个结构的三维形貌，并能够生 ...

Core Viewpoint - The research conducted by BGI and Southern University of Science and Technology has created a groundbreaking 3D single-cell spatiotemporal multi-omics atlas of Drosophila development, providing unprecedented insights into the molecular mechanisms of cell-type differentiation and developmental biology [2][4][25]. Group 1: Research Methodology - The research team utilized BGI's proprietary spatiotemporal omics technology, Stereo-seq, along with single-cell sequencing techniques (scRNA-seq and scATAC-seq) to sample key stages of Drosophila development, generating over 3.8 million spatially resolved single-cell transcriptomes [3][7]. - The Spateo algorithm was employed to reconstruct high-precision 3D models, allowing for detailed analysis of tissue morphology and gene expression dynamics [7]. Group 2: Key Findings - The study systematically analyzed the spatiotemporal dynamics of cell-type differentiation in Drosophila, revealing critical regulatory networks that govern developmental processes [4][9]. - A "differentiation trajectory map" was constructed, elucidating the molecular mechanisms behind cell fate determination, with transcription factors acting as key regulators [9][22]. - The research identified previously uncharacterized transcription factors that play significant roles in the nervous, digestive, and endocrine systems, expanding the understanding of developmental regulation [9][22]. Group 3: Developmental Patterns - The 3D multi-omics atlas revealed the spatial patterns of tissue differentiation, with distinct developmental modes observed in the fat body and fore/hind gut [11][13]. - The fat body exhibited a dispersed differentiation pattern, while the fore/hind gut showed a centralized characteristic, providing new evidence for understanding embryonic gut formation [13]. Group 4: Central Nervous System Development - The study highlighted key nodes in the morphological remodeling of the central nervous system, identifying new regulatory factors associated with neural progenitor cell migration [14][22]. - The dynamic changes in midgut cell types and their spatial organization were tracked, revealing that midgut stem cells had already "prepared" for future differentiation during the larval stage [18][19]. Group 5: Implications for Human Health - Drosophila serves as a crucial model organism in various biological fields, sharing approximately 70% of disease-related genes with humans, thus providing valuable insights into human developmental diseases [9][25]. - The findings regarding the regulation of copper cells in the midgut may offer new mechanisms for understanding organ development in humans [22].

总体而言，该研究系统性地剖析了运动重塑人体生理、延缓衰老的关键分子枢纽，开拓了科学抗衰的新路径，为推进健康老龄化研究提供了重要的科学依 据。 （总台央视记者 帅俊全 褚尔嘉） △口服甜菜碱有效降低老年小鼠肝脏脂肪化，对照组（左）；干预组（右） 记者从中国科学院动物研究所获悉，该所刘光慧研究员、曲静研究员联合国家生物信息中心张维绮研究员、中国科学院动物研究所宋默识研究员及首都医科 大学宣武医院王思研究员团队，历时六年，首次系统解析了人体对急性单次运动与长期规律运动的分子-细胞动态响应谱，揭示肾脏是运动效应的关键应答 器官——其内源代谢物甜菜碱作为衰老延缓的核心分子信使，通过靶向抑制天然免疫枢纽激酶TBK1，协同阻遏炎症并缓解多器官衰老进程。这一成果北京 时间6月25日在国际学术期刊《细胞》发表。 △运动健康效益及其分子机制 在这项研究中，科研人员首次将运动适应性反应这一复杂的系统生物学问题解构为一个可量化的多组学动态网络。系统解析了单次急性运动与长期规律运动 后的生理适应表现与机制。研究首次解析了急性与长期运动的分子分界：急性运动激发"生存应激型"代谢风暴与氧化损伤，而长期运动则驱动健康导向的代 谢-免疫稳态重 ...

Core Insights - Illumina announced the acquisition of SomaLogic for $350 million in cash, aimed at enhancing its position in the growing proteomics market and accelerating its multi-omics strategy for 2024 [1][3] - The acquisition is based on a prior collaboration established in December 2021, focusing on integrating SomaLogic's protein detection technology into Illumina's NGS platform [3][4] - The global proteomics market is projected to grow from $33.6 billion in 2024 to $60.5 billion by 2029, with a compound annual growth rate (CAGR) of 12.4% [9] Company Strategy - Illumina's CEO stated that the acquisition will enhance the value of the NovaSeq X product and unlock greater potential for future advancements [3] - The integration of SomaLogic's technology with Illumina's scalable NGS platform and analysis software is expected to accelerate technological development in proteomics and reduce research time and costs [3] - The company aims to complete the acquisition by mid-2026, pending regulatory approvals, while both companies will continue to operate independently until then [4] Market Context - Illumina holds over 80% of the global gene sequencing market but has faced revenue declines and significant losses, particularly a projected loss of $1.223 billion in 2024 [6] - The company has been impacted by being placed on the "unreliable entity list" in China, affecting its business in the Greater China region [6] - The competitive landscape is intensifying, with rivals like Roche Diagnostics and BGI encroaching on Illumina's market share [6] Industry Trends - The proteomics field is seen as a critical area for future diagnostics and drug development, with the potential to discover new biomarkers and therapeutic targets [7] - Recent acquisitions in the proteomics space, such as Thermo Fisher's $3.1 billion purchase of Olink Holding AB, indicate a growing interest and investment in this sector [10] - Illumina's acquisition of SomaLogic is expected to strengthen its capabilities in the high-growth proteomics market, with profitability anticipated by 2027 [10]

特别提示 微信机制调整，点击顶部"仪器信息网" → 右上方"…" → 设为 ★ 星标，否则很可能无法看到我们的推送。 圣 地 亚 哥 2025 年 6 月 23 日 ， I l lumina 宣 布 已 与 Standard BioTool s ( 纳 斯 达 克 股 票 代 码 ： LAB) 签 署 了 一 项 最 终 协 议 ， 根 据 该 协 议 ， I l lumina将收购数据驱动蛋白质组学技术领导者SomaLogic和其他指定资产，收盘时需支付 3.5亿美元的现金 ，但需进行相关调整，加上 高达 7500万美元的短期基于绩效的里程碑和基于绩效的特许权使用费 。 I l lumina 首席执行官Jacob Thay sen表示， "收购SomaLogic将加强I l lumina在不断扩大的蛋白质组学市场的存在，并推动我们在2024 年宣布的多组学战略。 这将增强NovaSeq X产品今天的价值,并在未来解锁更大的功能。I l lumina和SomaLogic已经密切合作了三年多，这 种组合提高了我们为客户服务的能力，并加快了我们实现先进生物标志物检测和疾病分析的技术路线图。 " "我们正在将NGS ...

AI 助力多组学与机器学习联合分析 课题特色 ： 1. 零基础 无压力，R语言编程从入门到实战，快速打造你的生信分析基本功； 2. AI赋能 +CNS文献精读，带你高效拆解多组学科研的 经典范式与创新思路 ； 3. 全面覆盖 代谢组、蛋白组、微生物组（宏基因组和16s） 、 转录组 等热门方向，紧跟科研前沿； 机器学习分析多组学课程内容 第一节课 AI+多组学CNS论文思路解读 1.基于Deepseek高效阅读多组学的CNS生信文章 2.AI整理代谢组、蛋白组、宏基因组等多组学数据分析流程 3.Deepseek从多篇生信文献中快速总结提炼多组学数据分析方法 4.Deepseek评价多组学生信文章思路的创新性和数据分析可行性 第二节课 Deepseek辅助多组学生信课题设计 1.Deepseek辅助代谢组、蛋白组、宏基因组联合分析策略 2.AI指导代谢组、蛋白组、宏基因组、转录组交叉验证的思路 3.Deepseek汇总生信论文模板设计的层次和逻辑要点 4.Deeoseek辅助生信多组学数据研究热点挖掘 5.Deeoseek构建多个公共数据库联合验证有效策略 第三节：编程基础学习--R语言 1.R和Rstudio ...